После революции всё имущество П.И. Макушина было национализировано, но его заслуги в просвещении и благотворительности были признаны новой властью. Его семье предоставили для проживания один из его прежних домов, в 1922 г. он был приглашён на должность заведующего торговым отделом «Сибкрайиздата», а в марте 1924 г. его избрали товарищем председателя Сибирского отделения Всероссийского общества «Долой неграмотность!».

П.И. Макушин был похоронен, согласно его желанию, во дворе Дома науки. На его могиле высечен девиз всей его многолетней просветительской деятельности «Ни одного неграмотного», а также размещены рельс и электрический фонарь как символы стремления к знаниям. Могила была обустроена на пожертвования горожан.